Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLD1P28340 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLD1P28340 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLD1P28340 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLD1P28340 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLD1P28340 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms