Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRGP23470 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRGP23470 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms