Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHCGRP22888 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHCGRP22888 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms