Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD247P20963 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD247P20963 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD247P20963 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD247P20963 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD247P20963 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD247P20963 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms