Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI3P19429 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms