Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2CP19387 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms