Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRF1P14222 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRF1P14222 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRF1P14222 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRF1P14222 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms