Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA4P13612 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms