Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLBP1P12271 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLBP1P12271 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms