Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TOP2AP11388 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOP2AP11388 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms