Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EGFRP00533 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EGFRP00533 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EGFRP00533 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EGFRP00533 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EGFRP00533 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EGFRP00533 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms