Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms