Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ECM2O94769 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM2O94769 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM2O94769 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM2O94769 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM2O94769 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ECM2O94769 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ECM2O94769 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ECM2O94769 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms