Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F6O75461 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F6O75461 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms