Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KIAA0556O60303 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KIAA0556O60303 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms