Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD28O15084 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ANKRD28O15084 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms