Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3EO15041 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms