Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CLGNO14967 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms