Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYSRT1A8MQ03 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYSRT1A8MQ03 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms