Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SOBPA7XYQ1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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