Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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