Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms