Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SH3BP1Q9Y3L3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms