Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms