Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SNX12Q9UMY4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX12Q9UMY4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms