Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
INO80Q9ULG1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
INO80Q9ULG1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms