Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HACL1Q9UJ83 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms