Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC25Q9NXE8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CWC25Q9NXE8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms