Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DNAJC28Q9NX36 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms