Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC4BQ9NT99 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms