Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHST12Q9NRB3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms