Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRDM10Q9NQV6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM10Q9NQV6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms