Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRDM12Q9H4Q4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRDM12Q9H4Q4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms