Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BGRL3Q9H299 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms