Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXQ1Q9C009 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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FOXQ1Q9C009 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FOXQ1Q9C009 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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