Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIFKQ9BYG3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIFKQ9BYG3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms