Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5DQ9BY66 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms