Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2Q9BX26 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms