Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTDSS2Q9BVG9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTDSS2Q9BVG9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms