Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RTKNQ9BST9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms