Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCMH1Q96GD3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms