Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM52Q96A61 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM52Q96A61 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms