Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMPDL3AQ92484 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms