Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLNKQ7Z7G1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLNKQ7Z7G1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms