Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H9

FAM220A, Protein FAM220A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220AQ7Z4H9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM220AQ7Z4H9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM220AQ7Z4H9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms