Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPS6Q7L5N1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS6Q7L5N1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms