Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms