Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF544Q6NX49 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF544Q6NX49 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms