Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF18Q5VWM3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF18Q5VWM3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms