Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EFCAB2Q5VUJ9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EFCAB2Q5VUJ9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms